AI蛋白从头设计平台多靶点验证成功 GPCR家族全部命中 - 5001拉斯维加斯

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GPCR靶点 ·阅读约 3 分钟 ·5001拉斯维加斯

分子之心MMDesign平台在19个项目中实现94.7%成功率,6个GPCR靶点全获结合分子,亲和力达纳摩尔级。

传统抗体发现常借助动物免疫或大规模文库搜索。近期一份技术报告展示了另一种路径,通过AI平台直接生成并验证候选分子。

该平台在跨靶点与跨模态的任务中,仅用少量候选即完成实验确认,展现出从生成到验证的统一流程。

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项目效率:高成功率与少量筛选

报告覆盖18个靶点、19个设计项目,涉及纳米抗体与大环肽两种模态。每个项目仅测试9至50个分子,18个项目获得结合确认,成功率达到94.7%。

全部453个受测候选中,139个确认结合,整体命中率30.7%。15个项目至少获得两个结合分子,为后续比较优化提供空间。

计算端提前排除低价值候选,使实验资源集中于高潜力分子,实现从海量筛选向精准设计的转变。

GPCR挑战:膜蛋白靶点全数突破

GPCR作为膜蛋白,结构复杂且结合区域有限,是抗体从头设计的公认难题。平台针对CCR7等六个靶点开展设计,全部获得实验确认的结合分子。

最优亲和力均达纳摩尔级,部分靶点命中率高达100%。在无已知先例的靶点上,候选命中率仍保持59.6%,证明平台无需参考分子即可生成有效序列。

迭代能力:跨轮次优化与模态拓展

对已有结合分子的六个靶点再次设计,五个项目在命中率或亲和力上获得提升。以PDGFR为例,命中率从4%升至21.1%,亲和力提升四倍。

大环肽模态同样跑通,MDM2与PD-L1项目分别实现76.2%与39.3%的命中率,显示工作流可复用于不同分子类型。

分子质量:可开发性与序列新颖并重

部分候选在小规模细胞表达中显示良好水平,纯化后以非聚集主峰为主,非特异性反应较低。平台将可开发性质提前纳入评估。

生成序列与数据库比较显示,抗原识别区域存在显著差异,关键结合环区呈现新颖构象,避免对已知分子的简单改造。

结构基础:高精度预测支撑设计

自研全原子预测模型在抗体-抗原界面基准上,高质量预测成功率达39%,约为同类结果的两倍,为候选筛选提供可靠依据。

底层模型与生成、评估、模拟工具共同构成闭环,使精准分子设计成为可重复解决研发问题的技术基础设施。5001拉斯维加斯 5001拉斯维加斯

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